目前我國碳匯林業(yè)發(fā)展還存在以下問題：

　　森林經(jīng)營問題亟待解決　經(jīng)過近10年的重點林業(yè)生態(tài)工程建設，我國的森林面積快速增加，在國際上得到了認可。從森林覆蓋率、森林面積和活立木蓄積量等統(tǒng)計指標來看，在總體上均呈上升趨勢。但我國森林經(jīng)營不力，森林質量低下的問題仍然嚴重。天然林破損嚴重，人工林可持續(xù)經(jīng)營管理不夠，全國約有1億畝人工林為低產(chǎn)林，生態(tài)脆弱、生產(chǎn)力低下，不利于生物多樣性保護。森林通過固碳減緩氣候變化的潛力難以發(fā)揮。

　　缺乏全國統(tǒng)一的碳匯計量監(jiān)測體系　為了促進碳匯林業(yè)的發(fā)展，建立一套和國際接軌的、針對森林碳匯進行的科學計量和監(jiān)測體系，是確保碳匯林業(yè)健康發(fā)展的基本前提，也是科學制定生態(tài)補償標準的重要依據(jù)之一。目前，由于缺乏全國統(tǒng)一的碳匯計量監(jiān)測體系和標準，難以了解和掌握中國森林碳匯的現(xiàn)狀與發(fā)展動態(tài)與潛力；各地在評價其森林生態(tài)效益時，對森林碳匯進行的計算也因沒有統(tǒng)一的標準而使結論沒有可比性。

　　森林生態(tài)效益補償偏低　國家目前針對部分國家公益林實施的森林生態(tài)效益補償基金只有5元/畝，不能對公益林的保護產(chǎn)生積極有效的激勵。特別是集體林權制度改革后，農(nóng)民經(jīng)營林業(yè)積極性提高，而且近年南方省份發(fā)展商品林的態(tài)勢很好，農(nóng)民經(jīng)營商品林獲得的收入比以前大幅度增加。相比之下，據(jù)易碳家了解到，經(jīng)營國家公益林得到的補償基金遠低于木材的經(jīng)濟利用價值；此外，同地域、區(qū)位、地類和質量以及不同經(jīng)營主體的公益林，其管護成本和生態(tài)價值是不相同的，在投入水平上也會存在差異。國家補償標準單一，難以適應實際情況。

　　公眾對碳匯林業(yè)的了解不夠　近些年，氣候變化逐漸被公眾所認識，但是森林碳匯、林業(yè)碳匯、碳匯林業(yè)等諸多新名詞和氣候變化與森林的關系，廣大公眾不了解。有些人不了解《京都議定書》規(guī)則的條件，錯誤理解國際碳匯市場，認為森林吸收和固定的二氧化碳都可以進入市場交易。甚至有的企業(yè)利用碳匯概念炒作，誤導消費者，影響正常的生態(tài)服務市場的發(fā)育。