根據(jù)2001年《馬拉喀什協(xié)定》，清潔發(fā)展機(jī)制項(xiàng)目從開(kāi)始準(zhǔn)備到實(shí)施，最終產(chǎn)生減排量，需要經(jīng)過(guò)以下主要階段：

　　項(xiàng)目設(shè)計(jì)：清潔發(fā)展機(jī)制項(xiàng)目的概念設(shè)計(jì)階段。 

　　參與國(guó)的批準(zhǔn)：一個(gè)清潔發(fā)展機(jī)制項(xiàng)目進(jìn)行注冊(cè)，必須由參加項(xiàng)目的每個(gè)締約方的國(guó)家清潔發(fā)展機(jī)制主管機(jī)構(gòu)出具該締約方自愿參加該項(xiàng)目的書(shū)面證明，包括東道國(guó)指定的國(guó)家清潔發(fā)展機(jī)制主管機(jī)構(gòu)對(duì)該項(xiàng)目可以幫助該國(guó)實(shí)現(xiàn)可持續(xù)發(fā)展的確認(rèn)。 

　　項(xiàng)目審定：相關(guān)的技術(shù)準(zhǔn)備工作完成之后，項(xiàng)目企業(yè)選擇合適的獨(dú)立經(jīng)營(yíng)實(shí)體（DOE），簽約并委托其進(jìn)行CDM 項(xiàng)目的審定工作，基于項(xiàng)目開(kāi)發(fā)者提交的項(xiàng)目設(shè)計(jì)文件，DOE對(duì)CDM項(xiàng)目活動(dòng)進(jìn)行審查和評(píng)價(jià)。 

　　項(xiàng)目注冊(cè)：如果獨(dú)立經(jīng)營(yíng)實(shí)體DOE經(jīng)過(guò)審定，認(rèn)為該CDM項(xiàng)目符合清潔發(fā)展機(jī)制項(xiàng)目的核實(shí)要求，它會(huì)以核實(shí)報(bào)告的形式向清潔發(fā)展機(jī)制執(zhí)行理事會(huì)提出項(xiàng)目注冊(cè)申請(qǐng)。如果執(zhí)行理事會(huì)的審查通過(guò)，該項(xiàng)目可以進(jìn)行注冊(cè)。 

　　項(xiàng)目實(shí)施、監(jiān)測(cè)和報(bào)告：注冊(cè)之后，清潔發(fā)展機(jī)制項(xiàng)目就進(jìn)入具體實(shí)施階段。項(xiàng)目企業(yè)根據(jù)經(jīng)過(guò)注冊(cè)的項(xiàng)目設(shè)計(jì)文件中的監(jiān)測(cè)計(jì)劃，對(duì)項(xiàng)目的實(shí)施活動(dòng)進(jìn)行監(jiān)測(cè)，并向負(fù)責(zé)核查和核證項(xiàng)目減排量的簽約經(jīng)營(yíng)實(shí)體報(bào)告監(jiān)測(cè)結(jié)果。 

　　項(xiàng)目減排量的核查和核證：所謂核查：是指與項(xiàng)目企業(yè)簽約的經(jīng)營(yíng)實(shí)體對(duì)注冊(cè)的CDM項(xiàng)目在一定階段的減排量進(jìn)行周期性的獨(dú)立評(píng)估和事后決定。所謂核證，是指該指定經(jīng)營(yíng)實(shí)體以書(shū)面的形式保證某一個(gè)CDM項(xiàng)目的活動(dòng)實(shí)現(xiàn)了經(jīng)核實(shí)的減排量。根據(jù)核查的監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)，經(jīng)過(guò)注冊(cè)的計(jì)算程序和方法，經(jīng)營(yíng)實(shí)體可以計(jì)算出清潔發(fā)展機(jī)制項(xiàng)目的減排量，并向執(zhí)行理事會(huì)提交核證報(bào)告。

　　CERs的簽發(fā)：CERs是指核準(zhǔn)的溫室氣體減排量。指定經(jīng)營(yíng)實(shí)體提交給執(zhí)行理事會(huì)的核證報(bào)告實(shí)際上就是一個(gè)申請(qǐng)，請(qǐng)求簽發(fā)與核查的減排量相等的CERs.