隨著執(zhí)法力度不斷加大，不法分子也在挖空心思規(guī)避處罰、逃避打擊。有的企業(yè)利用暗管、灌注等隱蔽方式違法排污；有的企業(yè)私自修改環(huán)境監(jiān)測(cè)設(shè)備數(shù)據(jù)；有的企業(yè)與有資質(zhì)的處置企業(yè)相互勾結(jié)，非法處置污染物；有的企業(yè)跨行政區(qū)劃異地傾倒廢物。 

李軍剛說(shuō)，當(dāng)前，環(huán)境違法行為呈現(xiàn)出隱蔽化、專業(yè)化、團(tuán)伙化等特點(diǎn)，發(fā)現(xiàn)查處難度加大。從偵查打擊實(shí)踐來(lái)看，環(huán)境污染犯罪團(tuán)伙化、專業(yè)化趨勢(shì)明顯。一些犯罪團(tuán)伙，數(shù)十名成員分工明確，合作緊密，手段專業(yè)，發(fā)現(xiàn)難度高，造成危害大。

困難不僅源于不法分子越來(lái)越狡猾，還有很多客觀問(wèn)題阻礙打擊效力。

李軍剛分析說(shuō)，取證難、鑒定難、認(rèn)定難問(wèn)題依然突出。有些案件因?yàn)殍b定方法缺乏標(biāo)準(zhǔn)依據(jù)、鑒定時(shí)間長(zhǎng)等原因，在法定時(shí)限內(nèi)難以取得鑒定意見(jiàn)；有的地方能夠出具法定鑒定意見(jiàn)的機(jī)構(gòu)少，無(wú)法滿足實(shí)際辦案需要；有的污染物鑒定費(fèi)用或環(huán)境損害評(píng)估費(fèi)用動(dòng)輒數(shù)十上百萬(wàn)元，公安機(jī)關(guān)辦案經(jīng)費(fèi)捉襟見(jiàn)肘。

當(dāng)前，霧霾等大氣污染已成亟待治理的突出環(huán)境問(wèn)題，但由于大氣污染物流動(dòng)性大、稀釋速度快等原因，提取固定證據(jù)和責(zé)任認(rèn)定較困難，給公安機(jī)關(guān)查處打擊增加很大難度，影響打擊震懾效果。

“公安機(jī)關(guān)辦理環(huán)境污染案件時(shí)，還受一些地方保護(hù)主義干擾?！崩钴妱偺寡?，有的地方環(huán)境污染問(wèn)題的形成往往與地方政府片面追求GDP有很大關(guān)系，許多排污企業(yè)是地方招商引資來(lái)的利稅大戶，公安機(jī)關(guān)查辦這類企業(yè)的污染問(wèn)題容易受到干擾和制約。