配額的分配方式主要分為免費分配和有償分配。其中免費分配的方式對排污企業(yè)沖擊小，但由于不能提供準(zhǔn)確的價格信號，會造成市場扭曲。

相較之下，通過拍賣進行的有償分配方式能夠更準(zhǔn)確的為排放的社會成本提供價格信號從而提高市場效率，同時，拍賣所得的收入可以用于增加消費者福利和促進減排等事項。但拍賣也將給排污生產(chǎn)企業(yè)帶來更重的成本負(fù)擔(dān)。

對于面臨跨區(qū)域競爭的行業(yè)來說，拍賣帶來的生產(chǎn)成本增加將使轄區(qū)內(nèi)的生產(chǎn)企業(yè)競爭力減弱，這將增加碳泄露（即一個區(qū)域采用較嚴(yán)格的碳減排政策，導(dǎo)致相關(guān)生產(chǎn)性碳排放轉(zhuǎn)移至其它碳減排政策相對寬松的區(qū)域的情況）的風(fēng)險（張希良等，2021；Liu et al., 2016）。

考慮到拍賣方式對生產(chǎn)活動造成的壓力，一些碳市場在運行初期主要采用免費分配的方式，其后逐漸增加配額的拍賣比例。

歐盟碳市場在成立初期有超過90%的配額通過免費方式分配，其后通過拍賣分配的配額比例逐步增加，在第三履約期（2013-2020）中57%的配額通過拍賣方式發(fā)放。同時，考慮到區(qū)域間發(fā)展程度的差異，歐盟委員會為低收入成員國分配相對更多的免費配額。

此外，歐盟碳市場還根據(jù)不同行業(yè)的碳泄露風(fēng)險對其配額分配方式加以區(qū)分。對于碳泄露風(fēng)險較高的行業(yè)主要實行配額免費發(fā)放以避免碳排放轉(zhuǎn)移至其它碳排放政策相對寬松的區(qū)域；對于沒有碳泄露風(fēng)險或風(fēng)險較低的行業(yè)相應(yīng)增加其配額拍賣比例。美國加利福尼亞州的碳市場也制定了類似的碳泄露風(fēng)險行業(yè)列表來應(yīng)對潛在的碳泄露風(fēng)險（ICAP，2022）。

我國的全國碳市場目前采用免費分配的方式發(fā)放所有電力行業(yè)配額。在《碳排放權(quán)交易管理辦法（試行）》中提到，可以根據(jù)國家有關(guān)要求適時引入有償分配。