目前我國(guó)環(huán)境治理主要運(yùn)用三個(gè)手段，即指標(biāo)控制、項(xiàng)目審批、價(jià)格補(bǔ)貼，與傳統(tǒng)計(jì)劃經(jīng)濟(jì)時(shí)期的管理方式非常相似。在市場(chǎng)化進(jìn)程中，政府的這三種經(jīng)濟(jì)管理手段都在進(jìn)行改革，環(huán)境監(jiān)管領(lǐng)域的改革相對(duì)滯后。

一是指標(biāo)控制?！笆晃濉币?guī)劃中首次制定了3個(gè)節(jié)能減排約束性指標(biāo)，“十二五”規(guī)劃增加到7個(gè)。這些年，節(jié)能環(huán)保部門把大量精力放在這幾個(gè)指標(biāo)的分解下達(dá)、檢查落實(shí)上。這里涉及到如何對(duì)待政府制定的指標(biāo)問題。從上世紀(jì)90年代開始，國(guó)家就對(duì)計(jì)劃體制進(jìn)行了大幅度改革。計(jì)劃指標(biāo)從原來(lái)的約束性指標(biāo)，總體上轉(zhuǎn)變?yōu)轭A(yù)測(cè)性、指導(dǎo)性指標(biāo)；新設(shè)的幾個(gè)節(jié)能環(huán)保指標(biāo)則堅(jiān)持了約束性，完不成就要對(duì)地方問責(zé)。計(jì)劃經(jīng)濟(jì)時(shí)期制定和下達(dá)指標(biāo)要經(jīng)過幾上幾下、綜合平衡；分解下達(dá)節(jié)能環(huán)保約束性指標(biāo)則主要靠公式，地方與中央討價(jià)還價(jià)的余地比較小。每個(gè)五年規(guī)劃中，節(jié)能環(huán)保約束性指標(biāo)剛下達(dá)時(shí)完成起來(lái)很難，但經(jīng)過努力都能完成。這種相關(guān)主管部門自己定指標(biāo)、自己下達(dá)、自己統(tǒng)計(jì)、自己考核，缺少第三方參與的指標(biāo)控制方式，是否客觀、公正、有效，還有待進(jìn)一步驗(yàn)證。

二是項(xiàng)目審批。環(huán)評(píng)報(bào)告審批、節(jié)能評(píng)估報(bào)告審批是各類建設(shè)項(xiàng)目的前置審批事項(xiàng)。對(duì)這兩個(gè)環(huán)節(jié)有關(guān)部門把關(guān)很“嚴(yán)”，企業(yè)投入與耗時(shí)較長(zhǎng)。環(huán)評(píng)和節(jié)能評(píng)估一旦通過，實(shí)際執(zhí)行情況往往很難掌控，存在著“重前期審批、輕過程監(jiān)管”的問題。

三是價(jià)格補(bǔ)貼。為了將企業(yè)經(jīng)濟(jì)活動(dòng)的外部成本內(nèi)部化，世界各國(guó)采取的措施都是“誰(shuí)污染、誰(shuí)治理”，或者“污染者付費(fèi)制度”。而我國(guó)使用價(jià)格補(bǔ)貼作為治理排放的經(jīng)濟(jì)手段，凡脫硫、脫硝的發(fā)電企業(yè)，國(guó)家上調(diào)上網(wǎng)電價(jià)和銷售電價(jià)，補(bǔ)貼其增加的成本，也就說(shuō)“企業(yè)污染，消費(fèi)者付費(fèi)”。很多發(fā)電企業(yè)不按規(guī)定運(yùn)行脫硫、脫硝設(shè)施，電價(jià)補(bǔ)貼就會(huì)變成利潤(rùn)留在企業(yè)。消費(fèi)者出了錢，實(shí)際減排效果卻未達(dá)預(yù)期。